Ничего страшного. Игнорируйте и сохраняйте в нужных Вам пяльцах. Вообще такие предупреждения выскакивают, если дизайн изначально был рассчитан для таких пялец и подвергался увеличению. Это происходит только для формата pes. Иногда такое сообщение появляется при сохранении дизайнов, созданных в PE-DESIGN. Это не Ваша ошибка, это "премудрости" программы.